Blindspot Season3 เป็นเรื่องราวในอีกสองปีต่อมา แจน ใช้ชีวิตของเธอตามอย่างที่ใจฝัน แต่แล้วชีวิตของเธอก็กลับเข้าสู่เรื่องวุ่นวายอีกครั้ง เมื่อ Kurt Weller ได้รับภาระกิจใหม่ ให้เข้าไปช่วยเหลือเพื่อนร่วมงานของเจ้าหน้าที่ FBI ที่ถูกลักพาตัวไป ควบคู่ไปกับสืบหาที่มาของรอยสักที่อยู่บนตัวเธอ ตามติดไปกับการไขปริศนาของหญิงสาวลึกลับ Jane Doe (รับบทโดย Jaimie Alexander) จากจุดเริ่มต้น ที่เธอถูกพบอยู่ในกระเป๋ากลางไทม์สแควร์ ด้วยร่างกายที่เปลือยเปล่าทำให้เห็นรอยสักที่ปรากฏอยู่เกือบทั่วร่างเธอ ที่บังเอิญเกี่ยวโยงกับคดีต่าง ๆ ที่กำลังเกิดอย่างไม่น่าเชื่อ ทำให้พวกเขาถูกดึงเขาไปสู่โลกแห่งอาชญากรรมเดิมพันสูงที่สลับซับซ้อน